黄色が黒になって刷られていました

純正品を継続してお使いとのことですし、本体の故障を考えるのがだとうだという気がします。

追記。

互換品インクを使用している場合、インクカートリッジを間違った場所にセットしても、センサーが正常に動作せず、カートリッジの指し間違い（今回のようなCとMの入れ違いなど）を検知してくれない場合があります。

カートリッジの指し間違いをすると、プリンタ内部で２色のインクが混じり、インクが通る内部機構のすべてを交換する必要が出ます。

プリンタの部品を部分的に交換するのは工数が増えるので、実際の修理では、中身をすべて取り換える事になり、部品代だけでプリンタ１台分の価格に等しくなり、修理技術料や送料を加算すると、プリンタ１台分よりも高い修理費になります（想定外の使用方法、誤操作が原因なので、無償保証修理の対象外になります）

黄色以外に、マゼンタの発色も不良のようです。

症状から推測すると「CとMのインクを逆にセットした」か「CのタンクにMインクを補充し、MのタンクにCインクを補充した」という、誤操作によるものです。

プリンタの内部が、混ざったインクで汚染されてしまっているので、プリンタ本体をメーカー修理に出して、プリンタ内部の部品を交換してもらう必要があるでしょう。

修理費（輸送費、技術料、部品代実費）を考えると、プリンタを修理せずに廃棄して、新しいプリンタに買い替えた方が安く済むでしょう。

インクはメーカー指定の純正品を継続してお使いでしょうか？

ヘッドクリーニングを何回かされても改善しないのでしたら5時間程時間を空け、再度チェックしてみてはいかがでしょうか？
インク吐出経路に損傷や亀裂が生じインク漏れが発生することもまれにあるようです。
その場合は修理しか方法がありません。

まず、印刷品質チェックシートの印刷結果はどのようになっていたのでしょうか？
また、純正インクをご使用でしょうか？
どのくらいの期間、どういう環境にさらされ、どのくらいの量をどのくらいのインターバルで印刷されていたのかわかりかねますが、
おそらくインクヘッドが乾燥もしくはインク残渣の堆積物による目詰まりを起こしているのではないでしょうか。
過去に非純正インクをご使用されたことがありましたら、インク残渣堆積物が原因となることが多いです。
もしくはインクを入れ替えたのでしたらその際に気泡が生じ、気泡が消える（落ち着く）まで印字できない状態になっている可能性があります。
インクカートリッジを変えたから、ヘッドクリーニングして良くなったからといってすぐ改善することはほぼありません。
また1日にヘッドクリーニングを何十回してもさほど効果はありません。
時間を置いてから改善しているか状況を見ながら
毎日、ヘッドクリーニングを4回その後電源プラグを抜き1日放置
これを繰り返して良くなれば回復の可能性がありますが…
洗浄カートリッジを使用してみるという意見もありますが、洗浄カートリッジは純正品では存在しません。故障の原因となりますのであまりおすすめできません。
最終手段でのご使用を検討されると良いかもしれません。
プリンターの初期化、ファームウェアの更新やプリンタードライバーを入れ直して改善したというケースもありますのでご参考までに。
インクカートリッジを振ってみて改善したという都市伝説もあったり…？
改善の見込みがなければ修理となりますが、補修用性能部品の保有期間を既に過ぎている製品であれば、
修理をすることができませんので、残念ですが買い替えとなります。
以下、参照願います。

【インクジェット プリンター】インクが出ない/白紙になる/色合いがおかしい
↓↓↓↓↓
https://faq.brother.co.jp/app/answers/detail/a_id/10644/