アップロード後のスキャンができない問題について

アップロード：
利用者に物理的に一番近い機器（たとえばパソコン）から、
ネットワーク上の機器（たとえばクラウドのサーバ）にデータを移動することを言います。
極端な話、ファイルをコピーしたのと同じなので、
これによってプリンターやスキャナーに支障する、ということは考えられません。

似たような言葉に「アップデート」とか「バージョンアップ」等があります。
アップデート：
かいつまんで言うと、「利用中のソフトウェアを最新にする」こと。
たとえばWindowsでは、毎月、脆弱性対応やバグの修正用ソフトウェアが
提供され、これを適用することになっています。
たとえば筆まめでは、Ver.26の枠組みの中で、
時々、アップデートが行われます。

バージョンアップ：
かいつまんで言うと、ソフトウェアを丸ごと最新版に切り替えること
Windows7をWindows10にしたり、筆まめをVer26からVer.29に替えること。

たとえばパソコンのOSをWindows7からWindows10に切り替えた場合、
Windows7でプリンターを使っていても、そのままでは使えません。
一旦、Windows7の時点でプリンターを削除しておき、
Windows10にしてから、改めてWindows10のドライバーを
導入する形にしないと、不具合が発生します。

あたらしくパソコンを丸ごと買い替えた場合も、
いきなり接続してはダメで、Windows10用のドライバーを導入して、
画面の指示で、接続をしないと、適切なドライバーが入りません。
特に、複合機の場合は、
プリンター部分は汎用のドライバーが入ることはありますが、
スキャナー部分に汎用のドライバーが基本的に無いので、
使えない状態に陥ります。

というように、おそらくバージョンアップの事だと思いますが、
それにしても、お使いのコンピューターのOSなどが分からないので、
具体的な対応手順を助言することができません。

どんなファイルを何処にアップロードしたのか書いてないので不明ですが、
アップロードしたことでシステムが不調になることはありません。
　”アップロード”ではなく、”アップデート”や”アップグレード”であれば
バージョンの相違によりスキャン出来なくなることもあり得ますが、
お使いのPCやOSについて情報が皆無なので断定できません。

何が問題なのかが書かれていないので、判断ができませんが、

アップロードとスキャンはそもそも、無関係な
用語なので、何か問題があるのであれば、
この結びつきを一度忘れてみるといいかもしれません。

質問的には
「トイレに行ったらテレビが映らなくなった」
みたいな意味になります。
トイレとテレビの関係性が全くない事と、
テレビが映らない理由が誰にも分らないので、
答えようがないという、そんなイメージです。

何をアップロードしたのか不明ですしPCやOS等の詳細が分かりません。ドライバー等を再セットアップしてみてはいかがでしょうか。