印刷用紙の選択がA4サイズしか出来ない

https://support.brother.co.jp/j/b/producttop.aspx?c=jp&lang=ja&prod=mfcj6980cdw
こちらですね。

Win10の場合は有線LAN、無線LAN接続でプリンタを利用していると同一のネットワーク内のあるプリンタをWSDって機能で自動で見つけてドライバをインストールしてしまうことがあります。そちらのドライバだと本来選べるはずの用紙サイズが選べないような事があります。


フルパッケージダウンロード 【推奨】
https://support.brother.co.jp/j/b/downloadend.aspx?c=jp&lang=ja&prod=mfcj6980cdw&os=10013&dlid=dlf103168_000&flang=1001&type3=11
こちらのドライバをインストールしてし直してみるのはどうでしょうね。

・プリンター本体
・パソコンのプリンタードライバーの設定
[スタート（左下のWindowsマーク）]-[設定]-[デバイス]-[プリンターとスキャナー]-[管理]-[印刷設定]
・印刷時のプリンター印刷設定
・印刷しようとするアプリのページ設定
これらを今一度一致されているかご確認されてみてはいかがでしょうか？

【インクジェット プリンター】(動画)用紙トレイ1にA4用紙をセットする方法
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https://faq.brother.co.jp/app/answers/detail/a_id/13396/

【インクジェット プリンター】「トレイ設定が違います」と表示されました
↓↓↓↓↓
https://faq.brother.co.jp/app/answers/detail/a_id/10828

【インクジェット プリンター】「用紙サイズが不一致です」または「用紙間違い」と表示されました
↓↓↓↓↓
https://faq.brother.co.jp/app/answers/detail/a_id/9290

【インクジェット プリンター】用紙サイズ違いのメッセージが表示され正しいサイズで印刷できません
↓↓↓↓↓
https://faq.brother.co.jp/app/answers/detail/a_id/10638

改善しなければプリンタードライバーを入れ直してみてはいかがでしょうか？

ソフトウェアダウンロード
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https://www.brother.co.jp/download/software/index.aspx