赤インクが出ない

MFC-J6997CDWの印刷品質チェックシート出力は
https://support.brother.co.jp/j/s/support/html/cv_mfc6997cdw_jpn/doc/manual/index.html#GUID-448C3CA4-6940-4041-B158-15EBD16340B6_450
を実施されたのだと思います。

マゼンタのブロックにおいて、
欠けているところが多い、ということであれば、
ヘッドクリーニングで、カラーのみ、強力ないし超強力を選んで
https://support.brother.co.jp/j/s/support/html/cv_mfc6997cdw_jpn/doc/manual/index.html#GUID-09F6FFB7-C265-4C70-9CC7-2B2F3C37FEC3_439
実施してみてください。
※インク残量次第では新しいカートリッジが必要になることもあります。

年内の修理対応は厳しいと思われますので、
現状は、クリーニングを正しい手順で適切に行って回復を期す敷かないと思います。

修理をする場合は
https://www.brother.co.jp/product/support_info/repair_serv/mfc_color_inkjet/index.aspx
を参照してください。

印刷の質が悪いのですが。
https://support.brother.co.jp/j/b/faqend.aspx?c=jp&lang=ja&prod=mfcj6997cdw&ftype3=10012&faqid=faq00010281_009

色とも純正インクカートリッジと交換して、ヘッドクリーニングを数回行なってください。ヘッドクリーニングを数回してもまだ印刷の質が悪い場合はコールセンターへご連絡ください。


みたいな記載はありますね。取りあえず電源を入れたまま半日程度放置して再度ヘッドクリーニングを行っても改善しないなら修理に出すぐらいしか無いかと。

A3カラー/ビジネスインクジェット複合機の修理サービス
https://www.brother.co.jp/product/support_info/repair_serv/mfc_color_inkjet/index.aspx
ただ修理となると高いですね。