内蔵2.5インチHDD SSD簡単換装

＞コピーソフトはHD革命 copy drive Liteをつかいました
とのことですが、HD革命 copy drive Liteを使用したということは、
SSDの製品としては「ESD-IB0480G（2.5インチ SerialATA接続内蔵SSD）」でしょうか。
https://www.elecom.co.jp/products/ESD-IB0480G.html

＞ハードディスク 500gbをWindowsディスク管理のパーティションで200gbにしてからssd480gbにコピーしました。 懸念しているのは、このパーティションのやり方がダメなのでしょうか？
とのことですが、取扱説明書を参照しながらコピー操作をしましたか？

以下のページで「HD革命 copy drive Lite セットアップガイド」をダウンロードして参照しましょう。
https://dl.logitec.co.jp/index.php?pn=LHR-PBSU3S

で、「HD革命 copy drive Lite セットアップガイド」を開いて、「データのコピー手順」を参照してください。
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[4]コピーのオプションで「コピー先ディスクのディスクサイズに合わせてコピー」を選択し、「次へ」をクリックします。
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とありますので、コピー元のハードディスク内のデータが480GBよりも小さければ、パーティションで区切らなくても、500GB → 480GBならばコピーできそうに思いますが。。。

既にパーティションで区切ったので、そのままコピーし直すというのであれば、別の項目を選択してコピーしてみては如何でしょう？
ここでの選択が成否の鍵のように思いますが・・・。

AOMEI Backupper無料版↓　良ければどうぞ。

https://www.ubackup.com/jp/free-backup-software.html

AOMEI Backupperの無料版でのクロンで充分だよ。
お金出してクロンはする必要無し。

insert system disk in drive press any key when ready
システムディスクをドライブに挿入する 準備ができたらいずれかのキーを押す。

クロンの失敗です。
何のソフトでクロンしたのかクロンでなくデスクコピ－と同じ。
俺はAOMEI Backupperでクロンしたが簡単だった。
PC本体のHDDをusbでSSDにに繋ぎAOMEIソフトを立ち上げてクロンを選んで実行するだけ。
終わったらHDDSSDを入れ替えれば直ぐにWindowsが立ち上がる。

もう一度クロンし直したら。

BIOSがブート可能なドライブがない（Windowsが入っているドライブがない）と言っているのです。HDD→SSD移行には普通のコピーでは駄目です。クローンコピーが必要です。あなたのコピーアプリにはクローンコピー機能はありますか。もしあれば、それでやって下さい。なければ別のソフトを買って下さい。Acronis True Lmageが最適です。