観光協会と商工会との関連性について

NO2です。あまり多くを知っているわけではありませんが、
補足についての回答です。
>行政主体＝商工会、自治体補助金運営。独自型＝旅館などが出資して運営する民間経営ということでしょうか？

　いろいろだと思いますが、大規模な観光地を除いては、観光協会の費用は、行政からの補助金でしょう。観光協会の会費といっても、安いはずのなので（広く参加してもらうためには）、補助金や委託料が中心だと思います。観光協会が収益事業（パンフ販売、有料ガイド等）をしているところは少ないでしょう。
　商工会から補助金という場合もありますが、商工会字体が、行政の補助金が大部分を占めるはずです。自分たちの会費で運営しているとよくいいますが、７～９割は補助金（税金）のはずです。商工業者は、選挙でも有力な支持者なので、かなり補助金がなければ、やっていけません。

　商工会ということは、町村でしょうか（商工会＝町村、商工会議所＝市。おおまかに言って）。
　市町村合併の影響もあるでしょう。市町村合併したら、基本的には、観光協会も１本化されると思います（効率化が合併のメリットなので、行政はそうしたいはず）。中には、○○温泉観光協会など、市町村単位ではなく、一定の地域で観光協会をつくっているところもありますが、ある程度の観光地でなければ、難しいと思います。
　商工会も市町村合併したら、基本的には１本化を目指すはずですが、旧市町村単位で残る場合もあります（少ない）。

　商工会長＝観光協会長、事務局が商工会であれば、実質的には、商工会の運営なのでしょう。ただ、質問者さんのケースのように補助金頼みの組織だと思います。そして、その補助金も、これからの時代、不確定の要素が大きいです。

　事務局職員というと、会費の徴収、総会や理事会の開催準備、観光パンフの送付、電話での案内、ホームページの更新、物産展やイベントへの参加といったところが、仕事でしょうか。