都城から高知城までの行き方を教えて下さい。

宮崎在住です。
高知への交通手段は一般的には３択です。

１,飛行機
宮崎か鹿児島発で福岡乗り継ぎ。３時間で着きます。
最安値は片道25000円くらいです。

２,車
佐伯まで宮崎道と東九州道と１０号線で都城から３時間くらい。
宿毛から高知は２時間みておけば十分でしょう。
あとはフェリーの時間次第です。フェリーの時間と価格は調べられますよね。
1人だと往復25000円くらいでしょう。
間違っても八幡浜には行かない方がよいです。

３,公共交通機関のみ
２のコースをJRで行くと同じくらいの時間と価格です。
福岡経由バス(福岡から夜行)だと一番安いですがおすすめしません。12時間以上かかるでしょう。

ワタシのお気に入り。
(早くも安くもありません)
伊丹まで飛行機で神戸三宮までバス。そこからさらに高速バスに乗り継ぎで４時間。神戸三宮でなく大阪駅でも乗り継ぎはできますが分かりにくいのでキライです。(でも大阪駅の方が便数が多い)

どの程度の情報をお求めかわかりませんが、早くて安いなんて都合のよい方法は都会でないとなかなかありません。大抵は行くだけでも大変です。ましてや、公開の場で格安な秘密の方法は出てくるとは思えないです。
旅行会社にご相談ください。

佐伯から宿毛に行くフェリーの事でしょうか。

１人なら前後は列車にした方が安いと思います。２人以上は車の方が安くなる事が多いと思います。

都城～佐伯は特急で5540円、宿毛～高知は特急で4710円です。船の値段は参考URLを御覧下さい。

都城～宮崎と、須崎～高知は高速道路がありますが、その他の区間は一般道と線路しかありません。
列車の方が快適だと思いますよ。但し港～駅は、佐伯は徒歩・宿毛はバス200円かかります。