ボルトナットでフランジを固定する順番について

特に規定はないと認識しています。
弊社ではフランジ部がアルミ等や塗装面で傷付き易い材質の場合は、片側ではなく両側に入れる場合もあります。ですがナット側にはＳＷは付けずにＰＷ（ワッシャ）だけです。
私の感覚ではどちらでも良いと思っています。
しかし場合によっては相手がナット溶接の場合、止まり穴の場合などを考えるとボルト側に入れる方が間違いないと思っています。
参考で組み込みボルト（ＷＡソケット）という物があります。
これはボルトにＳＷとＰＷが組み込んであったり、ＳＷだけ、ＰＷだけ等がありボルトから外れない構造になっています。
先輩に何故か聞いてみては？きっと明確な答えは無いと思いますよ。

私も、先輩に賛成です。

ＳＷは緩み止めの効果があります。
そのため、精密な事を言えば、Ｗ抜きの方が効果は強いと思われますが、
私は（塗装品も含めて）フランジに傷が付くのでＷを入れるようにして
います。
また、締め込み方ですが、ボルトを固定しナットを回して締めていくので、
やはり、ナット側にＳＷがあることが望ましいと思います。
ＳＷは面で当るのが良いので、穴が大きめの場合はＷがあることで
効果が強くなると思います。

下記の図4.46のように、先輩が正しいです。

ナットのほうが小さくて振動などで動きやすいから、その側に緩み止めのＳＷを入れる。
でも、どちらでもいいではないか？と聞かれると、ウーン～

上の諸賢も回答されてますが、スプリングワッシャというのは、ゆるみ止めには殆ど効果がありません。その効果を標榜するメーカサイトに面白いビデオがあります。ナットのメーカでもデータがあったはずです。

http://www.nord-lock-jp.com/

平ワッシャというのも、軟質材なら判りますが、？？というのも多いように思います。
六角穴付きや、六角頭でもソケットレンチでガッチリ締める場合は、これらはかえって邪魔な気がします。同じ会社の金型部門は使わないのに、機械部門では使っている。。。