ハードディスク交換の費用はメーカー直送とパソコン工房では違うのか？

>オールインワンタイプのPC
ではわからないので出来ればお使いのPCの正確な型番を書きましょう。PC本体底面や背面に貼られたシールに記載があります。

https://support.nec-lavie.jp/navigate/support/repair/guide/expense/index.html
修理に出してHDDを交換となるとかなりの高額になります。

>起動が遅くなったのでハードディスクを交換したい
自分で分解してHDDを交換するか？HDDをSSDに換装するような手もありますね。起動が遅くなっただけなら最悪は再セットアップしてPCを購入時の状態まで戻せば少しはマシになることもあります。

現状のHDDの中身のまま大容量のHDDやSSDの換装は、HDD／SDDの価格＋手数料です。手数料は、約20,000～30,000です。一番安価に換装する方は、HDD／SSDを通販等で購入して自身でHDD／SSDのクローンを作成し換装することです。換装手順は「パソコンHDD換装」と入力しネット検索すれば、同じ機種はないと思いますが画像、動画で紹介されています。換装できそうかはパソコンの裏蓋を開けてHDDの位置を確認するのが良いと思います。クローン作成は簡単出来ると思います。

パソコンの修理で一番簡単なのはHDD交換です。ご自分でやられたら如何ですか。ケースを開けて、配線SATAケーブルと電源ケーブルをはずして取り外し交換するだけです。費用はHDD購入代金5000～8000円だけです。やり方は下記を参考にして下さい。ノートの例ですが、オールインワンタイプも取り外し交換作業は似たようなものです。SDDへの交換ですが、HDDとSDDの形状的な仕様は同一です。
https://www.youtube.com/watch?v=AbaG87FImZA

ご自分でやる場合の総額は・・・・
用意するハード：
クローン機能搭載の物は、下記の物
エラースキップコピー＆消去対応 USB3.0接続 3.5/2.5型 SATA SSD/HDDx2 スタンド
https://www.kuroutoshikou.com/product/case/original/kuro-dachi_clone_erase_eskp/

ＳＳＤ：
MX500 CT1000MX500SSD1/JP
https://kakaku.com/item/K0001028335/

プラスドライバー
プラスドライバーでも、数種類あるので出来れば先端を取り替えれるラチェットタイプの物
総額：2万円未満

メーカーに頼むと・・・・・
上記の予想総額に対して、人件費が上乗せされます。

自分で行う場合の利点：
１．クローンした物を元のパソコンに入れ替えるだけなので、設定はそのまま残っている関係上、蓋を閉めたら今まで通り使える。
２．メーカーに依頼するより安価

メーカーに依頼する場合：
１．メーカーは、ＨＤＤの交換するだけなので初期化された状態で戻ってくるので、自宅に届いた際に、セットアップから行わないといけない。（それなら、ＨＤＤだけ送ってくれよ！と思ってしまうレベルで、作業費取るな！と言いたくなる）
２．ＨＤＤの交換だけなので、メーカー保証が延長された訳でもなくＨＤＤの故障時の無償交換期間も延長された訳ではないので、セットアップ時にＨＤＤの初期不良が発生し使用不可の場合は、有料交換です。（ショップでパーツを購入した時は、１週間の初期不良交換が有るのに・・・）

なので、簡単な事なのでご自分でやられては如何でしょうか？

パソコンは量産型にした時点で、パソコンに詳しくない人でも組み立てられる様に、作られているので開けて見れば、電源とデータの配線しか無く簡単に外せるので、それと同じものを買えば良いのですが、見た事が無い人にとってはブラックボックスで、間違えたら失敗したらと恐怖の箱でしか無いのでしょう。
メーカーへの直接持ち込み又は郵送での修理は工房手数料で一割程安くなるかも知れませんが、大きな違いでは無いと思います。
何処に住んで居るか分かりませんが、近くに店舗などでは無くパソコンを修理する所はありませんか？
ネットで調べてみてはいかがですか、有れば2/3位で交換できるのじゃ無いだろうかと思います。