ScavSnapでのデータ変換に関する問題

ScanSnap Homeアプリから文書を右クリックで
アプリケーション連携＞Wordに変換　をしているという事でしょうか。

手持ちの見積書PDFを変換してみましたがびっくりするレベルで枠線までキレイに変換されました。
Excelでも試しましたが文字の認識と枠線はばっちりでしたがレイアウトは崩れてしまいました。

試しに同じ見積書をWEBサイトで変換してみたところ、まったくOCRされず丸ごと画像ファイルになってしまいました。
ですからアプリケーション自体は高精度だと思います。

ScanSnap Homeの設定からはほとんどいじれる項目がなく、できるのは言語の設定くらいでしょうか。
ですのでもしかしたら文書自体が読み取りに適していないのかもしれません。

解決策ではなくて申し訳ありません。

そのスキャンしたデータはPDFとして保存されていますでしょうか？
でしたら、以下ページで変換して正常に変換できるようであれば、
そのソフトのOCR機能が低能ということになります。
https://www.ilovepdf.com/ja/pdf_to_word

こちらでもうまくいかないようであれば、スキャン性能が悪いもしくは原稿そのものが悪いということになります。

スキャナで読み込んだ後、OCR（文字認識）させているソフトの設定を見直すくらいでしょうか。
元原稿の鮮明度や文字サイズによってはOCRの精度が落ちることもよくあります。元の原稿を見ていないので推測ですが。