鉢植えの草花やトマトで育成差が出る理由

地植えの根張りも畑（庭）の耕し具合も関係します。場合により
深いプランターの場合の方が畑よりフカフカで根張りが良いことも
あります。地植えと鉢植えの違いだけでは生育の良否は判断できない
と思います。生育の差は土の体積も関係しますが、通気性、作物に合った肥料、ペーハー、水持ち、水はけ、土壌温度、なども関与すると思います。

https://xn--m9jp3ya3i5308a7pvb.com/%E3%83%88%E3%83%9E%E3%83%88%E6%A0%BD%E5%9F%B9qa/%E3%83%88%E3%83%9E%E3%83%88-%E6%A0%B9%E5%BC%B5%E3%82%8A.html

↑ こちらをご覧になって下さい。これによると、トマトの根張りは垂直方向に1 m、 水平方向に2.4 m、深さ30〜50 cmくらいのところに密に生えています。
かなり広く深く根を張る野菜です。

さらに、【トマトプランターの育て方】もご覧ください。桃太郎を育てた記録が紹介されています。
これによると、60ｃｍ 深型プランター（30リットル） に２株、30 cmのものには1株が目安と書かれています。質問者さんは、いかがされていますか？
肥料や支柱、敷きわら、追肥、芽かき、摘芯などについても書かれていて、私は結構ためになると思いながら読みましたので、ご紹介した次第です。

※他にミニトマトの育て方についても書かれています。質問者さんのトマトが通常サイズか、ミニトマトなのかが私には今ひとつ不明でしたので、念の為。

既にご存知のことばかりでしたら、すみません。

畑（地植え）と同じ土を大きな鉢（例えば径30cm深さ40cm)に入れ栽培すれば差は出ないのではありませんか。鉢植えの分水はけがよいので鉢植えの方が良く育つ場合もありそう。でも土の水分量は鉢の方が乾きやすいので管理は地植えとは変えないとだめ。液肥の効果は正しい使用法なら地植えも鉢植えも同じだと思います。
その植物の根が十分に育つ容積の鉢であれば地植えと同様に生育させられると思います。

土より上、土より下
ほぼ同じ体積が必要です

地下茎が育たなければ、上のほうも育ちません。

　植物は基本的に地上部分と地下部分が同じ形、同じ規模なので、地上部分が鉢より大きくなることは元々無理が生じてるんじゃないかと思いますよ。鉢に応じて小さく仕立てればいいんじゃないですか。