まず何て言ってメッセージを送れば良いのでしょうか

ご自身が義姉の立場だったら、と
想像してみてはいかがでしょう。
どんな言葉も不要ではありませんか？
関係ないヤツは黙っとけ。ではないですか？

別件でLINE、これはnfepiyurehik様が
必ずしなければならないのでしょうか。
できればご主人にしてもらった方がいいです。
どんなことも
関係がこじれる火種になる可能性があります。
一度発した言葉は
それが相手にとって傷つく言葉であっても
元に戻せません。
LINEだと文字なので余計伝わりにくく
たとえそれが気遣う言葉であっても
空々しく思われるでしょう。

触れないことです。
相手が何か言ってくるまで。

なるべく流産には触れないこと。
体調はいかがですか？から始まって
回りくどくせず簡潔に内容をまとめ
最後に次会えるのを楽しみにしています。とか
今度ぜひ遊びに来てくださいとか、遊びに行きますとか。
最後の一言はそんな感じで。
間違っても、今回は残念でしたね。。。次は絶対！なんてダメですよ。
触れないでおきましょう’。

私は元気です。お変わりないでしょうか。
と流産に振れない方が良いでしょう。

お義姉さんの体調を気遣う言葉で良いのではないですか？
お義姉さん体調はいかがですか？などいつもの言葉でそういった内容から始めたら良いと思います。
赤ちゃんのことに関してはやはりあなたは女性だし義妹なので心理的な部分で恨みを買う(お義姉さんがそんなつもりは無くてもやはりその部分はデリケートなので)可能性もあるのであくまでお義姉さんを気遣う言葉のみにした方が良いです。

本来ならご主人に頼んでも良いのかなと思うのですがあなたからでないとダメなのでしょうか。

　人が悲しんでいるところにやってきて「さぞお悲しいことでございましょう」などと告げる奴ほどしょうのないやつはいない、と司馬遼太郎は書きましたが、人の悲しみを言葉で治療することは出来ず、そんなのは、こんなことを言うなんて私って良い人でしょという宣伝でしかない。同時に同じ不幸の中にいる人以外は他人の不幸をきれいな言葉で修飾してはいけません。こんな時に当人にLINEで連絡しなければならない要件が本当にあるかどうかもあやしいものです。当人のお兄さんを通して伝えることがなぜできないのか。