大学院の理不尽な制度変革

大学院の理不尽な制度を変えたいのですが

私はある国立大学の大学院修士1年なのですが、自分の大学院のとある制度について不満があります。
私の大学院では本科とは別に連携大学院としてあるコースが開講されており、
その内容というと近隣の他大学院の単位互換科目を含めた所定の単位を取得すると
コース修了証を発行し就職などにも便宜をはかるというものです。
講義を受けるだけで修了要件を満たせるので言ってみれば学部の副専攻に近い制度でしょうか。

このコースには定員があり選抜された学生のみがコース履修生になれます。
しかし、ここに私が非常に不満に思う制度上の問題があります。

このコースの関連講義はあくまで定員が満杯になった場合にコース履修生が優先して
履修できるというだけであって、別にコース履修生でなくても空きがあれば受講できます。

そのため一度コース履修生に選ばれなければ、どれだけ多くの関連科目の単位を優秀な成績で取っても
コース修了生としては認められず、逆に一度コース履修生として認められればギリギリの単位でも
コース修了として認められ就職でも優遇されるという現象が起きてしまっています。

コース履修生はあくまで講義を受講しているだけであってなにか特別な研究をしているわけでもありませんから
同様の講義を履修した一般学生とやっていることは何も変わりません。
それにも関わらず、入学後の成績や取得単位数を無視してコース履修者のみを優遇し続ける制度はあまりにも理不尽でナンセンスだと思います。

コースの選抜が努力が必要な学力試験ならまだ納得がいきますが、
実際にはたった10分間の口頭試問もなにもない面接で選抜が行われました。
どういう基準で選んでいるかも非常に不明確です。

どちらにしろ入学直後に行った10分間の面接の結果と、一年間の取得単位数と成績、
どちらがより明確に本人の能力と努力、学力の確かさを示しているかといえば明らかに後者であると考えます。

このような後天的な努力を一切認めないかのような制度が、それなりに歴史のある国立大学で、しかも文部科学省の特別な支援を受けて行われているというのは非常に腹が立ちます。

そんなわけで私はこのような大学の制度を不満に思い出来れば変えたいと思うのですが、どのように動けばいいでしょうか？なにか外部に不満を訴えるような機関などはないでしょうか？

そもそも私の不満はまっともうなものでしょうか？

ご意見をお願いします。