実弟の妻である、義妹の妹さんが他界されました。私は実弟の結婚式の時に一

＞メールで義妹に簡単にですがお悔やみをお伝えしています…

それはそれでよいのですが、喪主はどなただったのでしょうか。
あなたもしくはあなたの妻とは、「甥」とか「いとこ」とか一言で言い表せる関係の方だったでしょうか。

というのも、通夜や葬儀にお参りするのは、故人にではなく喪主・施主に対する儀礼です。
このご質問のタイトルを拝見したとき、一瞬考えないと関係がつかめませんでしたが、喪主はさらに一代ぐらい遠い方ですよね。
あなたから見たら「弟の妻の妹の子」あたり、逆から見れば「親の姉の夫の兄」でしょうか。

香典を出したところで、
「はて、この香典誰から？」
「誰か知っている？」
となるようでは、近い親戚ではなく虚礼に過ぎないことになります。

しかも、親戚間での冠婚葬祭は、ギブアンドテークが建前です。
慶事にしろ弔事にしろ、一度金品をもらったら、近い将来に相手方で同じようなことがあったとき、同じようにお返しをするのです。
はたして相手方が今後ずっと、あなたと親戚関係を続けていく意志があるかどうかも、考える必要もあります。
必要以上の祝儀、不祝儀ははなはだ迷惑になることもあるのです。

＞この場合私はどのような方法でお悔やみをお伝えするのがいいでしょうか？（お香典の額、お悔やみのお手紙など…

冠婚葬祭の激しい地域でない限り、これ以上なにもすることはないと考えます。