四十九日法要のみ参加者に対する　香典返しの時期は

地方のしきたりで特に葬儀は本当に異なるので、実情を知らないのに一般的な話をするのもどうかなとは思いますが；
皆さん書かれておられるように、四十九日まで香典返しが終わっていない、と言う方がマズいでしょうね。
とりあえず急ぎ、香典返しだけは済ませてしまっては如何でしょうね。

申し訳ないけど用語が違います。

香典返し、というのは香典へのお返しです。
香典というのは葬儀に出席するかたがお持ちになるものです。

ですから葬儀が終わったあとでお渡しするものです。
四十九日の前だとかは無関係です。葬儀のあとで早めにやるのが好ましい。

四十九日は法要です。葬儀ではありません。
ですから、香典返しとは言いません。寸志です。
葬儀に参列しないで法要に来られる方もおられるだろうし、葬儀だけでその後の法要はご遠慮なさるかたもおられます。
これは普通のことです。
法要は法要だし、通夜葬儀とは別のものだからです。

ですから、葬儀に参列して四十九日にも来られた方、というような区別をするのは好ましくありません。

四十九日や百箇日なんていうのはそれぞれ別の行事ですから、その都度、参加されたかたにお礼をするという独立した考えをしてください。
そして、法要の場合は香典返しではありませんので、それもご注意ください。

告別式と四十九日のお返しは同じではありません。

告別式に参列された方へのお返しは、「香典返し」です。
わたしの地域では、当日返しとして返礼品を渡しますが、多額の香典を頂いた方のみ、香典返しを送ります。
品物は、四十九日前に届くように送ります。

それと四十九日の法要のお返しは別です。
法要に参加される方は、お供えやお金(御仏前)を包んでこられますから、全ての方にお返しをします。
四十九日法要で用意する品物は、四十九日法要に出席する方からいただいたものへのお礼にあたります。
ですから、質問者さまの場合、「香典返しと法要のお返しをもらう方」、「法要のお返しのみもらう方」にわかれます。
お返しは、法要の席に用意しておき、各自持ち帰ってもらいます。
わたしは表書きを「志」としてお返ししましたが、「粗供養」とする地域もあります。

告別式のお礼を早くに送って
法要のみ出席者には「当日はお荷物になると思うのでご自宅宛に送らせていただきます」とあいさつして、本当に来ていただけたら準備して送る。
告別式での香典返しをその場でしなかったということもちょっとあり得ないことなのですが・・・。簡単な物も当日渡していないということでしょうか。それなら丁寧な礼状と共に早急に送るべきです。

告別式に参加された方の香典返しを
四十九日のタイミングでするのは失礼じゃないですか？
遅いと思います。もしまだなら先に済ませておくことです。

四十九日に初めて来られる方の御供え（香典代わり）の
お返しは、四十九日後の方が良いでしょう。
当日その場でやってしまうと、式から来られた方は
ずいぶんと待たされたのに、四十九日の方は即日なわけで
それもそれで何かしらの禍根のようなものは残ると思います。