預け入れ後、残高に全く反映されていません。

銀行のシステム屋さんです。

それは流石に有り得ないなぁ。。。途中でエラーにならないはずがない。
自動販売機のボタンを同時押しして２個ジュースが出るくらい有り得ないです。

て言うと話が終わってしまうので

まずは異動明細を確認してみて下さい。
お金の出入りが１件ずつ分かるヤツです。
通帳記帳、もしくはインターネットバンクから見る事が出来ます。
インターネットバンクに登録しているのならそっちの方が簡単です。今すぐできます。

例えば貴方が残高だけ見て
「あれ？残高が30万で2日まえに2万をいれたはずだから32万のはずなのに30万しかない！」
と思っているとします。
異動明細ならこの2日間のお金の出入りが全部分るので、ひょっとしたらこの2日の間に何か自動引き落としが有って2万円引かれたのかもしれません。

その引き落としが何だったの確認しましょう。
思い当たるものがあるのか、思い当たらないのならひょっとしたら詐欺かもしれないし。

すぐ確認するとしたら、電話窓口があります。
おそらくインターネットバンキングやテレフォンバンキングに特化するかわりに、通帳などが省略された口座なのだと思います。その場合、カードの裏側にテレフォンバンキングの番号、りそなだとコミュニケーションダイヤルの電話番号が記載されています。
以下を見ると今現在の時間でもオペレーターは待機してるようです。
https://www.resonabank.co.jp/kojin/internet_tel_bank/tel_bank/

手順としては、アプリではなく、ブラウザのインターネットバンキングか、テレフォンバンキングで、残高を確認します。反映されてないなら、テレフォンバンキングでオペレーターに相談します。

以上、参考にならなかったらごめんなさい。

通帳を見ればいいじゃない。それに預金したときに、控えあるでしょ。それが証拠になるので銀行に問い合わせましょう。

通常稼働しているATMではそのようなことはアリえません。
本当にご自身で入金をしたのでしょうか。
　　他の人に入金してもらったとか
　　ご自身もその場に居たけど、他の人に操作をしてもらった
なんでオチではないでしょうか。疑うのはその操作をした人です。
対象のカードを使用していれば別の口座に入金するようなことは出来ません。

または、クレジットカードと兼用のカードで、逆方向にATMに入れて、
債務の返済の操作をしたとかです。

もし、ATMに搾取されたと主張するのであれば、正確な時刻と共に
警察に被害届を出してから銀行に行くべきです。

送金をした時の明細は手元にあるのでしょうか。
なければ対応は相当大変です。

間違って別の口座に入金した可能性があります。ATMで預け入れをした時の明細がないと、どこに振込んだのか探すのは難しいです。