他大学の他学部の大学院に行きたい

はじめまして。

事情は大体わかりました。もし信州大になってしまった場合、大学院進学時に東大や京大などの食品系の研究室のある他大学の院に進めるかどうかということですね。

結論から言えば、試験にさえ合格すれば問題なく可能なはずです。とくに東大を始めとする旧帝の院試は完全に内部生も外部生も同じ条件の試験をパスしなければならないので、実力さえしっかりついていれば、問題なく合格できます。とはいえ、そうするためにはあらかじめ指導を受けたい教授や準教授などに連絡をとり、実際に研究室に訪問し、合格した場合自分の思うような研究をさせてもらえるかや、受け入れ定員は大丈夫かなど諸々を確認しておく必要などはあります。これについては教えて！gooで「研究室訪問」と検索をかければいろいろな情報が得られると思います。

実際に、僕は私立大理工から旧帝の工学部の院に合格しました。同じ工学部ではありますが、全く違う専攻です。試験の範囲が数学以外は学部では一切学ばなかったところばかりでしたので、それなりに苦労はしましたが……。

というわけで、もし信州大になっても院で専攻を変更することは制度上は可能なはずです。しかし、細かい事情が違ってくるかもしれませんので、最終的な判断は質問者様ご自身で大学の教務に確認をとるなりして、確実に行ってくださいね。もしダメだったと言われても責任はとれませんので……（苦笑）参考として以下に東京大学大学院農学生命科学研究科のURLを添付しておきます。そこに院試の募集要項がPDFでありますので、1度読んでみてはいかがでしょうか。また、名大に行ければそれにこしたことはないので、前期試験、頑張ってください。合格できることをお祈りしております。それでは、参考になれば幸いです。