結婚式返信ハガキに欠席理由を書たいんですが。

欠席される場合でも、基本的に返信ハガキには一言お祝いの言葉と欠席する事へのお詫びの一言を添えるのがマナーですよね＾＾
質問者さんの場合は事前に「産後の時期だからどうなるかわからない（難しい）」ということを相手にお伝えしているのでそのままの理由を書いて問題ないと思います。
特に忌事でもありませんし。
『このたびはおめでとうございます！産後の体調が不安定でご迷惑をおかけするかもしれないので大変残念ですが欠席させて頂こうと思います。』とか…

その上で、電報を出すとか、後日ご祝儀なり結婚祝いなりを贈ったり改めて電話やお手紙でお祝いの気持ちを伝えたり。
後々のフォローさえしっかりすれば相手が嫌な気持ちになることはないと思いますよ＾＾

ただの欠席で返信を出し、後日電話で具体的理由とお詫び、御祝いの言葉、を伝えたらいかがでしょう。
ハガキは形に残るものなので、ここは事務的な返送をさせてもらったほうが
相手にも心的負担は少ないと思われます。

文章にすると形式ばって書きにくくないですか？
葉書は欠席としてだして電話で理由を伝えるほうがいいですよ、おめでとうとも言えますし

そのまま書けばいいと思います。
「ご結婚おめでとうございます。あいにく産後まもなく
長時間の外出が難しいので欠席させていただきます。」
という感じで分かってもらえるのではないでしょうか。