芯出し作業のポイントと注意点とは？

はじめまして。
現在の職場で設備機器の保全業務を担当しているのですが，現在まであいまいなままでやってきたことがありまして，その点についてお尋ねしたいと思います。

１．ポンプやモーターの据付け時に芯出しをするのですが，ゴムカップリングを使用して直結している場合に芯出しの精度としてどの程度必要でしょうか。普段＋－5/100を心がけているのですが，先輩方の中には「ゴムカップリングの場合は少々の誤差があってもかまわないから20～30/100ぐらいは大丈夫。」という方もいます。確かにゴムである程度は吸収するので・・・とも思いますが，実際にはどうなのでしょうか。

２．芯出し精度で5/100といった場合，その値は実際の値（誤差）ですか？それともダイヤルゲージの読み値でしょうか？（読み値ならば，ゲージで5/100の場合，実際の誤差は2.5/100になると思いますので。）

３．面間の誤差を見た時，例えばモーターのカップリング側が5/100低い場合には，シムライナーを誤差の二倍分（この場合は10/100）カップリング側に追加するか，ファン側から抜くかをして水平をとっております。このやり方は先輩方に聞いて現在実践しているのですが，何か数学的な根拠のある修正方法なのでしょうか。根拠のある数式等あれば教えていただきたいです。

４．技術の森の過去ログで芯出し方法に関する記述を見たのですが，芯出しをする場合にモーターを留めているボルトは2箇所のみを外しモーターを浮かすとありますが，この方法ではシムを敷くためモーターを持ち上げた際に，緩めていない2本のボルトに負荷がかかるので，ボルトに対してよくはないのではないでしょうか。また4本同時に緩めても芯出しに影響はないような気がするのですがどうでしょうか。

以上の４点についてお聞きしたいと思います。よろしくお願いいたします。