油圧シリンダの異音(コンコン打撃音)

圧力を掛けた際にフレーム締結部分や補器類(ネジ部分など)がズレて、圧力が抜けた際に元に戻る時の音じゃ無いですか？(圧力が下がった後に音が出てると思います)
加圧の時も同様の音が出てるはずですが、負荷が大きいとモーター(ポンプ)音に紛れて聞こえないと思います。
もしくは、微小なクラックのズレる音とか？
どちらにしても、原因は、上記の事で発生してると思います。

聴診器や危険箇所には、無線の聴診器モドキにて、打撃音箇所を特定しましょう。

また、シリンダのどの動作モードで出るのかも確認しましょう。

そして、原因を特定するための材料を細かく収集しましょう。

打撃音は、デスクではなく、現場で発生しているから。

プレスにはよくVパッキンが使用されていますが、その締めすぎとかでパッキン抵抗が増えるとハンチングという現象が起こります。
通常の物質は静摩擦係数>動摩擦係数です。
パッキン抵抗が大きいと、ある程度まで静摩擦係数でピストンが踏ん張り、限界を超え動き出すと動摩擦係数なのでポンと動き、圧力が下がるので止まる。
この繰り返しで「コンコン・・・・」となるわけです。
また、回路内にエアがあったり、ホースが長かったりすると、圧縮性やホースの膨らみでひどくなる場合があります。
対策は、エア抜き、パッキン再調整、ロッドの研磨状態確認、ホースを高圧用に交換等になると思います。

意外なところでは、サクションフィルターの目詰まり等で、ポンプの吸い込み抵抗が増えると、キャピテーションを起こします。
その場合も「カンカン・・」となります。
意外と回路上のどこでなっているのかわかりにくいものですから、その辺も疑って見てください。

メインシリンダは複動タイプでしようか。

複動タイプだった場合、ピストン部の構造が判らないので的外れな回答になっているかもしれませんが、Ｖパッキンを使用しているケースでは、Ｖパッキンが摩耗（又は破損）して、軸方向に遊びが出来てしまっている可能性を考えます。

この場合に、シリンダのロッド側に加圧すると、ピストン部の部品が先に動いて金属音発生させていることを検討してみることは必要かもしれません。

プレフィル弁が開く時の音という場合もあるかもしれません。