両面印刷の際の紙詰まりの原因は？

用紙の挿入がちゃんとされているとした場合は、ローラと用紙のいずれかに問題がありそうですね。
ローラの対策は別の回答者のとおり、プリンタクリーナなどでクリーニングされたほうが良いでしょう。
用紙は、片面を印刷した直後は少し湿気を含みますので、裏面印刷にかかるとき、湿気が原因で紙送りがうまくできないことがあります。良く乾燥するまで待つか、両面印刷可能の用紙を使うかされてはどうでしょうか。

未使用機ですが　他にも症例はあるみたいですね
http://d.hatena.ne.jp/briareos156/20101226/p1

2007年製でもあり　送りローラーの汚れや劣化が原因のように感じます
クリーニングシートを通しても変わらない場合は
http://cweb.canon.jp/e-support/faq/answer/inkjetprinter/50547-1.html
用紙送りローラーの劣化と割り切った方が良いように感じます

一般的には裏面印刷時にのみ稼働するローラーの片すべりかな？と思います。
あと、紙質によっても「やすい」「にくい」があるかもしれません。