理系の研究者になる流れを教えてください

工学系大学教員です．

ところどころで，助手とか助教授とか古い情報が出ていますね・・・
助手はアカデミックポストではなくなっていますし，助教授というポストは無くなっています．
念のため．

以下，工学系の話です．
ANo.3さんの回答が実情に近いと思います．
もっとも順調にいった場合は，
博士→助教→(講師)→准教授→教授
となります．
講師は（少なくとも工学系では）あまり見かけません．

順調にいかなかった場合(普通の場合)は，
博士→ポスドク→(助教)→(講師)→准教授→教授
です．

企業を経て大学教員になる場合は，
博士→企業の研究所→(准教授)→教授
という流れになるでしょう．企業から助教になる例はあまりありません(企業をすぐ辞めた場合は別ですが)．
十分に経験を積んでからいきなり教授になる事が多いように思います．

研究者になることの難しさについては皆さんが書いているとおりので，割愛します．

博士号取得から非常勤研究者（身分が不安定）
それから、助手などになります。
よほどの覚悟がなければそんな進路は考えない方がいいですよ。

皆様のご発言には異議はありません。

　忘れてはならないので、基本中の基本は”ポストの空き”がないと、
話にならないので、ご注意を

博士号取得までは他の方の回答の通りです。

問題はこの後で、
・研究のレベルやアウトプット（論文数）
・人脈
はもちろんですが、募集のある分野でなければ、いくらレベルが高くても大学研究職のポストが空きません。また１人の公募に１００～２００人の応募があることはざらです。

１００～２００人の中で、トップと認められなければ（もしくは選ばれるだけの人脈がなければ）、研究職になれません。

ストレートに進学して博士号を取ってしまうと、専門を捨てたとしても社会人経験が全く無いため、民間への就職は困難です。ご注意下さい。

日本学術会議によると、理工系での博士号取得者数は年間約五千人、大学や研究機関の教育・研究職への就職は約千五百人とのことです。
　他の進路に進む人もいるのでしょうけど、任期つきの非常勤を転々とするうちに高齢化するポスドクも増加していて、理工系のポスドクは約九千五百人だとのことです。

　学術会議としては、国にきちんとお金を出してくれという提言を出しているそうです。詳細は
http://www.jcp.or.jp/akahata/aik07/2008-10-03/2008100309_01_0.html
をご覧ください。

　ちなみに、「博士号取得後から研究者？大学教員？になるまで」については、「博士（はくし）がひゃくにんいるむら」
http://www.geocities.jp/dondokodon41412002/
が結構実情をついていると言われています。（最後のページの不明＝××という決めつけはいかがなものかとされていますが…）
　未読でしたらご一読を勧めます。