収入・支出は同一口座？別口座？

口座を分けることに本質的な意味はないと思います。

口座を分ける理由は、管理のしやすさ、金利と利便性、振込手数料、ペイオフ対策などが挙げられます。
それは、それぞれの個人のライフスタイルや貯金額、具体的にどの銀行に預けるかによって違ってきますので万人に通用するベストな選択はありません。

案1と2の違いは、生活費用に別の口座を設けるかどうかですが、家計をきっちり管理できるなら案1で無駄にお金を動かす手間をかける必要はありませんが、細かくつけるのが苦手なら案2で専用の口座に分けたほうがわかりやすいでしょう。

＞しかし、このやり方だと入金し忘れとかのリスクがあるな…と思ってきました。

我が家は給与振込口座から貯蓄口座へは自動振替です。
自動振替は同一行同一名義であればたいてい無料です。
生活費の引き落とし口座へは給与口座からいったん引きだして
現金で入金しています。もし不足があっても
総合口座であれば定期をセットしておくことで自動融資が受けられます。
金利がもったいないですが、即日入金すればいいことですし
残高不足に備える保険と思えばと、割り切っています。

各自、税金や私的保険料払いなど
本人名義口座からしか払えないものがいくつかあるので
全部をどれかにまとめる、ということができません。
そのため家計簿ソフトで各口座残高と手元現金を管理しています。
先の方がアドバイスなさっているように、
口座情報とクレジットの引き落としはWebから取り込みできます。

複数の収入源がある場合、より複雑になるでしょうから
ご家庭でおカネの流れを把握できる方法なら案(1)案(2)
どちらでもいいと思います。回答になっていなくてすみません。

給与口座と引き落とし口座は一緒でいいと思います。

重要な点は、貯蓄用口座を別にしているかどうかです。

貯蓄用口座に給与口座から自動で振り込みされるような仕組み作りをしておくと、自分で毎月振り込まずにすみます。

moneyforwardなどの家計簿アプリに銀行口座とクレジットカードを登録すれば、自分の資産の流れが見えてわかりやすいですよ。