プリント時の配紙の前方と後方の選択について

未使用機ですが

前面カセットは普通紙　普通の厚さ（0.08～0.12mm）の用紙だけ
後トレイはキヤノン製純正用紙の厚さ全て（0.08～0.3mm）の用紙
https://faq.canon.jp/app/answers/detail/a_id/94684

ですね
前面カセットに普通紙以外の厚い紙をセットしてはいけない　という使用制限

前面カセットに厚い紙をセットすると　紙詰まりを起こす　詰まる事で故障させてしまう場合があります

この機種は後トレイを開けていると前面トレイが無効になる機種だったかな？
印刷するアプリによっては別途セットしたトレイの指定が必要な場合もあります

機種名を書かなければ説明出来ません

「時に後方から給紙するよう指示が出て」というのが、印刷するときの(自由になる)設定で意図せず設定されているのか、用紙のサイズ・種類で後ろから給紙する必要があるのかで対応は変わりますが、後者であれば変えられないと思います。私が使っている違う機種では、封筒やハガキは後ろから給紙することになっています。

説明書に用紙サイズや用紙の種類での使い分けが書いてあったら、それにしたがって下さい。お使いのプリンタの機種が分からないので、このくらいのアドバイスしかできませんが。

一般的には、前方のトレイから紙を搬送するとプリンタの奥で小さな曲率で反転することになるので、厚みのある紙（写真用紙）などは、私は後ろのトレイを使っていますが、マニュアルに書いて無くて、綺麗に印刷できるなら、どちらでも良いのではないでしょうか。