自動プロの代替について

T-ICについては知りませんが、
ＰＣのＣＯＭポートの番号も一応確認されて見ては？。
（ディスクトップＰＣでシリアルボード等を後からつけた場合、ＣＯＭ１、２とは限りませんので。うちのＰＣでは、ＣＯＭ５に割り付けられています。）

コントロールパネル→システム→ハードウェア→デバイスマネージャ→ポート(COM とLPT)　をクリックすると確認できます。（ＸＰ）

もし、ＣＯＭ番号が１，２以外の時は、
下記ＵＲＬに、ＣＯＭ1７まで対応したシェアウェアがあります。

　http://nctool.jp/

T-ICとデスクトップ（ＸＰ）で確認しました。
ソフトはWIｎ_RS V0.249
コネクタは専用ケーブル＋９PIN変換器
（9PIN変換器はストレート。リバースのものがあるかどうかわかりませんが）

T-IC側の設定
BAUDRATE SW
1 OFF
2-5 ON
6 OFF
7 ON
8 OFF

WIN_RS 側
4800　STOP2

簡単な送信ファイルを作成してテストしました。
送信ファイルには前後に％が必要です。
これは今まで使われていたファイルでしょうから問題ないと思いますが。

Win_RS側の設定で「無変換入出力」にしています。

ＣＯＭの設定は間違ってませんか。
デスクトップだとＣＯＭ１だと思いますが、二つついているＰＣもあります。

ディップスイッチを同じようにしてみてください。

>「T-IC⇔PC」の接続ですが、普段「T-IC⇔MC」のデータのやり取りに使用している専用ケーブルに「D-SUB25－9ピン変換アダプタ」を付けて接続しています。

D-SUB25ピンを9ピンに下げてPCに刺しているということでよいでしょうか？
この部分がすこし怪しい気がします。
標準的な変換アダプタでは、対応できない場合もあります。
D-SUB25ピンで使用しているピンをまず調べるほうがよいかもしれません。
調べた後、変換ケーブルの結線図を確認して、必要なピンが接続されているか確認してください。

ポーレート　ビットに問題が無ければＲＳ２３２Ｃ接続ケーブルの種類を確認してみては。
クロスとストレートが有るはずです。

弊社ではＭＣの横にノートＰＣを置きＭＣとＲＳ２３２Ｃ接続し別室ＰＣで作成したデーターを無線でＭＣ横のＰＣへ転送しＭＣへ読み込んでいます。
Ｔ－ＩＣメモリーと言うのは転送機のことですよね。
年代不明とのことなので　故障した場合の修理・買い換えを考えると（買い換えで約１５万程度と思うますが）ノートＰＣ中古のＰ２００（中古で３万５万）程度で十分可能ですので　コスト的にも操作的に良いと思うので検討されてみてはいかがですか。
弊社では何の問題も無く可動しております。
（ノートＰＣの転送ソフトは同じくＷＩＮ＿ＲＳを使用）

問題を整理すると
今まで自動プロで作成したプログラムを、自動プロの出力機能でＴ－ＩＣメモリーに転送していた。
これからはパソコンで作成したプログラムをＴ－ＩＣメモリに転送したい。
ということですね。

Ｔ－ＩＣメモリーへはどんなソフトでも転送できると思います。ボーレートの設定だけだと思います。
Ｔ－ＩＣの設定を取説で確認されていますが、実際はＴ－ＩＣ本体のディップスイッチで設定されていたと思いますが。
もう一度、Ｔ－ＩＣとパソコンのソフトの設定を確認しましょう。
ボーレート４８００で確実に動作すると思います。随分前にＷｉｎ＿ＲＳでやったことがあります。

上手くいかない状況を具体的に書いてください。
ソフト側に表示されるエラー内容とか。