薄板重ね加工で困っています

当方も金型の調整用のシムとして薄板をよく加工します。
くっつき対策として、3rd加工までまわしています。
3ｒｄまで加工すると、電気がかなり弱くなるので、ほとんど端面の溶着が問題になることはありません。はがすことを考えれば周長にもよりますが機械で加工してしまったほうが楽ですから。
また、0.01程度の薄板ですと、それでもくっつくことがあるので、間に薄い銅板をはさんでセロテープではがしてます。
試してみてください。
溶着の問題はワイヤーのメーカー間でもばらつきがあるようです。おそらく電源設計の違いなのでしょう。ちなみに当社はFANUCを使用しています。

必要な寸法精度や何枚くらい重ねて加工しているか分かりませんが
一枚、一枚の間に少し厚め（t0.5位）のシムをサンドイッチ状態にして加工
されてはいかがでしょうか。

確かに加工面溶着によるSUS同士の固着が発生するんですよね。当方でも経験あります。特に今回の鋼材は非常に薄いことから加工熱をもろに受けてしまいます。当方ではSUS304CSPの0.5mmの重ね切り(20枚)で同様に現象が発生したので、ワイヤは出来るだけ小径(例えばφ0.1mm)の物を使用し、絶対熱量を減らした上で、鋼材の間に紙をサンドイッチして加工したら問題なく加工出来ましたよ。

ワイヤーカットの原理は電気をワイヤーに流し加工する機械ですので基本的端面は溶けてしまうのでくっ付いてしまいます。
もしも近くにウォータージェットをお持ちの会社があればそちらへ頼まれてみたら如何でしょうか？
水を高圧にしてカットする為、くっ付きなどのトラブルは有りませんが・・。
材料が３０４ですので錆などの心配もないと思いますが。