アルマイト処理による細目のボルトとナットのかみあいについて

普通に加工して、普通にアルマイト処理して、
タップとダイスを通し直せば済む事じゃないのか？
それで何か不都合があるのか？　難しく考え過ぎ。

コストダウンで、アルマイト後の加工を省きたいなら、
そんな設計にしなければ良い。

そもそもボルト・ナットに、アルマイトする？

細めのネジの精度ですが、ナットとボルトで締め込みが出来る程度でＯＫですか。
通常ネジ加工の精度はボルトはリングゲージ、ナットはプラグゲージで「ＧＯ」「ＮｏｔＧＯ」で確認します。ゲージは２～３種類のランクがあります。弊社で使用のゲージはＡ，Ｂ，ＣのＢ級です。安い転造機械ですのでＡ級なんかの加工は無理と判断してます。
膜厚の件ですがアルマイトでは無くメッキの事例です。
通常ネジ部のメッキ厚さの指示は５μです。ネジ部の膜厚測定できませんので感覚ですが、１０μ以上であるとリングゲージの「ＧＯ」は入りません（不確かです）。でもナットは組めます。
膜厚を考慮したネジ加工は測定道具を如何するかだと思いますよ。
例えばＡ級ゲージでＯＫならばアルマイト処理しても勘合できる？
ネジひとつとっても結構確認事項が多いです。
とにかく何でもＴＲＹしてください。良い経験になり、今後の仕事に役立ちますよ。

増減があり処理屋さんに寸法の注意を喚起する程度なのが実情かと。加工では公差のド真中ねらい。

アルマイト処理そのものは素地を食って、少し嵩が増える膜を作る。
しかしその前に強アルカリ・カセイソーダを用いた洗浄処理があり、これが素地を幾分か溶解する。
そのトータルでは少しマイナスになることが多いと思います。

はめあい公差を適用する穴などはアルマイト後に加工すべきなのか、悩むところです。

参考URLをご覧下さい。
10μmのアルマイトを施そうとした場合、母材の中に約5μm入り込み、
母材の元の表面よりの約5μm盛り上がるとお考え下さい。

15μｍのアルマイトでは、ボルト及びナット双方がアルマイト厚の約50%の
7.5μm程太りますので、この関係を考慮の上で母材の加工寸法を決めること
が望ましいと思います。