メッキ処理後の機械加工について

基本はメッキ後の状態を想定して設計は行われるものです。
中には何も考えずに仕上がった後に騒ぐ人がいるのも事実です。
だから、仕事を受ける前に発注者に懸念事項の確認と責任の範囲について確認はすべきです。第三者に聞く前に相手に確認したほうがすぐに解決すると思います。（相手にもよると思いますが。。。）

めっきや塗装といった表面処理は最終加工ですので、機械加工の後が基本です。めっき後に加工したら、例えば穴開けであればそこから腐食が進んでしまいます。
おっしゃる通り寸法変化は懸念ではありますが、そこは先方で保証する事ですので、懸念だけお伝えすればよろしいかと思います。

　仰るように、長大なワークに対して何かしら後加工をすると、歪みなどの懸念は増大しますね。
　ただ顧客が要求する項目として『メッキ品質』が上位にくるなら、加工後のメッキの方が妥当です。
　加工時の固定や移動での擦れ剥がれその他の懸念が拭えませんし、そもそも加工部はメッキが無い状態で仕上がる訳ですから。
　要はどちらを取るか、という話にしかならないように思えます。

　もし私が御社の営業なら、加工後のメッキ処理による歪み等の懸念について明らかにした上で、その部分については一切の保証範囲外として、いわゆる「出来成り」で話をつけたい案件ですね。

車輪の通るレール用途の５ｍ材について、加熱を伴うメッキ処理を行うが歪みの発生が予想されるが大丈夫か？
許容範囲分からないので、大丈夫かどうか回答できません。

私なら、歪み（ソリ？？）のリスクを先方に報告し、トライを提案します。
普段５ｍ材クラスの材料を扱っていないのであれば搬送用のジグも必要でしょう。
トライ費用は上長、及び営業と相談。
トライ内容は先方に相談ですか・・・最低限、処理時の温度の上限下限を考慮した温度をトライ条件として設定する必要があるかと思います。

今回の場合は、メッキ処理側の懸念は大物=大面積を処理する場合の瑕疵（キズ、ムラなど）の求償区分ではないかと思いますが・・・

メッキ厚みと歪みの量によっては最小メッキ厚み確保が重要、十分な検討必要ですね