DS-60000での両面スキャン時のずれについて

なんかPFU万歳な方がいろいろおっしゃっていますが...
PFU自慢されても質問者様の課題解決にはつながらないですからね...

まずハード/ソフトウェアの状態ですが、
エプソンのサイトを見ると、
DS-60000自体のファームウェア更新が結構あります。

それらはすべて適用済みで、最新の3.42に更新済みでしょうか？
(過去の更新履歴を見ると、「サイズ自動検知に失敗する件」等記載あります...)

またドライバ兼取り込みソフト「EPSONScan」も
PCのOSに合致した最新バージョンでしょうか？
同じくホームページには結構なドライバのバージョンアップ履歴があります。

切り分けとして、
ファームとドライバを最新バージョンの組み合わせに更新することで、
取り込んでみていかがでしょうか。

また、取り込み時の設定ですが、
自炊用途であれば、用紙のサイズは基本的には固定のはずなので、
原稿サイズを自動認識せず、A4などの固定で取り込むことをお勧めします。

この条件でも取り込み結果が異常になる場合は、
ADF部の不良が疑われるかと思います。

ところで、両面のスキャンが必要とのことですが、
どの程度の精度をお求めなのでしょうか？

両面スキャンをする場合、DS-60000のように
フラットベッド＋ADFの組み合わせでは、
表面終了後「原稿自体を動かした後に」裏面をスキャンする、
という事情から、
PFUが強いScanSnap系や、エプソンではDS-5x0などの
「A4シートフィードスキャナ」のように、紙の移動は一回で、
両面を同時に読み取る方が精度の確保としては圧倒的に優位ですし、
限界も出てくると思われます。

質問者様がDS-60000を選んだ背景には、A4シートフィードでは不足する
A3原稿を折らずに両面スキャンしたい、などのニーズがあったのでしょうか？

私はPFUのScanSnapを使用していますが「結果として取り込まれた画像のはじにグレーの帯ができてしまうことがあります。」ということは経験ありません。
自炊で数万枚の両面スキャンをしましたが・・・

位置ずれに関しては不具合ではなく仕様では？

ADFのドキュメントスキャナに関してはPFUに一日の長があります。
後発メーカーは特許などに抵触しないようにしなきゃならない関係から安定動作にどうしても不安が残ります。
これは事務機器としてのコピー機の話として聞いたのですが、先行メーカーは簡単な構造と信頼性の高い技術に関して特許をたくさん保有しているので、後発メーカーはどうしても構造が複雑になり安定性も悪く故障も多いのは仕方ない・・・と、サービスマンに聞いたことがあります。

なぜEPSON製品を選んだのか知りませんが、少量ならそのくらいは手作業でなんとかしてもいいと思いますが、大量だとやってらんないですよね。
お金をケチって莫大な手間がかかっているのだとしたら「安物買いの銭失い」。
多少高くても評価の高い機種を買ったほうが結果的に安上がりなことも多々あります。

私の場合、ADFで複数枚取り込まないための機構が備わっていたのがPFUの製品くらいしかなかったからほぼ一択だったんですけど、結果的に正解でした。
それでも不満がないわけではありません。
ADFにセットできる枚数が仕様より遥かに少ないこと(^^;
紙質や紙厚、湿気具合により変わるんでしょうけど、もう少しセットできれば文句なしだったんですけどね。

それと、スキャン不良はどうしても出てしまいます。
その時はPDFなどに変換するソフトで不要な余白をカットしたりしているので結果的にスキャン不良を不良として気になるということはありません。
そのソフトはスキャナ付属ソフトではなくフリーで公開されているソフトです。
自炊ユーザーには昔から定番とされているものなので探せばすぐ見つかるでしょう。


いずれにしろ、フラットヘッドスキャナで自炊していた頃と比べたらものすごく楽ちんになりました。
昔はPhotoshopでスキャンしてレベル補正や傾き調整などの調整をしたあとAcrobatでPDFにして保存という恐ろしくカネと手間のかかることをしていましたからね。
※AcrobatはReaderではなく3万円の有償版の方。Photoshopは10万円のCS。
自炊ユーザー御用達ソフトを使うと傾き調整とレベル補正を自動でやってくれます。