2台のプリンター

状況から
・LANをDHCPで運用している
・2台のPX-046AのIPもDHCP設定である
・パソコンにインストールしたPX-046Aドライバのポート設定が、
[Standard TCP/IP Port]で作成している
上記がそろっている状態で、
たまたま2台のIPアドレスが入れ替わったときに、
意図しない側に出力された、と考えます。

これを回避するには、エプソンが配布している、
EpsonNet Printを導入して、
ポートを[EpsonNet Print Port]で作成することです。

[Standard TCP/IP Port]は基本的にIPアドレスしか見ないので、
同じ機種でIPアドレスが入れ替わった場合には、現象が出ます。
[EpsonNet Print Port]は、IPアドレスだけでなく、
プリンタ固有のMACアドレスも見るので、仮にDHCPでIPアドレスが入れ替わっても、
MACアドレスの紐付けがあるので、入れ替わることはありません。

すでに[EpsonNet Print Port]で作っている場合でも、
前バージョンで
・複数のプリンターがある場合に自動追従ポートを使用すると、
別のプリンターに印刷データを送ってしまう事がある点を修正しました。
というかなり重要なバグが修正されているので、
下記ページで最新バージョンに更新することをお勧めします。
EpsonNet Print
http://www.epson.jp/dl_soft/readme/20543.htm

これで1Fと3FのそれぞれのPX-046Aのアイコンにポートを設定し、
印刷時に使い分けることで対応できると思います。