ファームウエアを書き換えられるのでしょうか。

セキュアブートはWin8の必須条件でないため、対応していなくともWin8へのアップグレードは可能です。
(セキュアブート機能が利用できないよとの情報です)
http://ameblo.jp/7th-sfg/entry-11405234522.html

それよりも、富士通のパソコンとのことですので、拡張機器のドライバが対応しているかどうかの方が問題と思われますので、富士通さんのサイトで情報が出ていないか確認してからアップグレードを検討してください。

富士通が貴方が使用中のPCに対してWindows8対応アップグレードサービスを行っていればファームウエア（BIOS）がHPに公開されます。
Windows８に対応する為のドライバーやアプリケーションのアップデートも必要ですのでメーカーがWindows8対応を表明していない機種はそのままお使いください。
PCはOSとセットで１つの商品です。
自己責任でWindows8をインストールする事は出来ますが当然サポートはありません。

ファームウェア　＝　周辺機器（光学ドライブやSSDなど）の制御プログラムで、機器内のROMに書かれていますが、製造メーカー指定の方法で書き換えが可能です。

ただこの場合は、ファームウェアではなくBIOSの事を指しているのかな？
と思ってしまいます。

いずれにせよ、PCの型番不明なので、これ以上調べられません・・・

ファームウエアーはハードウエアとソフトウエアーの中間的な存在で、
ROMに焼きこまれたプログラムです。書き換えはできません。