FMVFE90DBY でWindows10の初期化

この機種はもともとWindows10未対応ではないですか？

>初期化しようとしたら、添付の言語やキーボードの種類等を選ぶ画面でキーボード、マウス、タッチパネル全て反応せずその先に進めません。

「初期化しようとしたら」ではなく、「初期化したあと」ですね。
Windows10の「設定」内にある初期化は、Windows10をインストールした直後の状態に戻されます。購入直後に戻されるわけではありません。よって、FMVFE90DBY特有のドライバソフトは全て削除され、一般的なデスクトップPCとしてセットアップが進みます（USBキーボード・USBマウスなら操作可能です）。

タッチパネルを有効にするには、専用のドライバーソフトが必要ですので初期化してしまったら動作しません。
キーボード・マウスも、恐らく専用のワイヤレスドライバーが必要だと思いますが、初期化したら消えてしまいますので繋がりません。

本来なら、FMVFE90DBY専用のリカバリディスク（若しくはハードディスクリカバリ）からリカバリをすると説明書には書いてあると思います。それを怠ると、全て自力でセットアップしなければなりません。

リカバリディスクを作成してあるのなら、説明書通りリカバリディスクを使ってリカバリをすれば良いです。
リカバリディスクが無いのであれば、ハードディスクリカバリしか方法がありません。しかし、それすら上手くいかない場合は、富士通のサポートからリカバリディスクを購入する事になります。