ボルトのSとMの違い

　質問者は自動車関係の方でしょうか？

　だとすれば、これは誤記ではないと思います。とある大手自動車メーカーでのローカルのはずです。
　その自動車メーカーに不利益が生じる可能性があるため、ここで詳細を記載することは出来ませんが、

?Ｓ１０×１．２５というローカルの規格が確かに存在する
?Ｓ１０×１．２５とＭ１０×１．２５は似て非なるものである

　以上２点が、そのメーカーさんとの付き合いの上でわかっています。
　私も不思議に思って問い合わせた所、割と簡単に教えて頂けたので、直接そちらに尋ねたほうがよろしいかと思います。

　お役に立てず申し訳ないですが、参考まで。

どうでしょう。
違う見方で。。。
もしその表記がローカルルールで細目のつもりで
Sを付けているとしたら。。。
図面は特に規制もなく作成されているものですので、作成者に伺った方が
よいとも言えますよ。
但しローカルルールは他人には通じない。

ＪＩＳにあるねじの記号で「Ｓ」とは「ミニチュアねじ｣（ＪＩＳ　Ｂ0201）です。

名称の通り、ごく小径のねじで、おねじ外径φ0.3mmの　S0.3　からφ1.4mmの　S1.4まで、14サイズがあります。

このことから考えて、S10X1.25は、おそらくM10X1.25の誤記でしょう。

おっと失礼。

建築関係のほうには「羽子板ボルト」と称するものがあってその記号が「Ｓ」でした。

ただし、ねじ部についてはＪＩＳの並目なので、細目ではいささか矛盾します。

使用されている場所や、製品の形状等、差し支えない範囲で御教えいただければ、もうちょっとマシなお話ができるかも・・・