MFC-J997 　長形40号印刷をしたい

以下ページなどが参考になりますでしょうか？
対応可能な用紙サイズのプリンター機種をお持ちで、用紙サイズ一覧に無い場合は用紙サイズの一覧の一番下にユーザー定義がありますのでクリックしてこちらでサイズを指定してみてはいかがでしょうか？
また、プリンタードライバの再インストールで解決する可能性もあります。

Word 封筒に宛名を印刷するには？（縦書き）
↓↓↓↓↓
https://www.jpita.or.jp/simin/index.php?wordziten88

封筒印刷がうまくいかない場合の対処法（ブラザーブログ）
↓↓↓↓↓
http://sblog.brother.co.jp/weblog/2015/09/post-eeca.html

封筒印刷のポイント～用紙サイズを設定できない場合～
↓↓↓↓↓
http://sblog.brother.co.jp/weblog/2015/09/post-b511.html

【レーザー プリンター】封筒にしわが寄ったり折れ曲がって印刷されます
↓↓↓↓↓
https://faq.brother.co.jp/app/answers/detail/a_id/13104

【レーザー プリンター】使用できる封筒について
↓↓↓↓↓
https://faq.brother.co.jp/app/answers/detail/a_id/9738

【インクジェット プリンター】封筒のセット方法や印刷設定方法
↓↓↓↓↓
https://faq.brother.co.jp/app/answers/detail/a_id/9917

多目的トレイに封筒をセットして印刷する
↓↓↓↓↓
https://faq.brother.co.jp/app/answers/detail/a_id/9918

【インクジェット プリンター】封筒のセット方法や印刷設定方法
↓↓↓↓↓
https://faq.brother.co.jp/app/answers/detail/a_id/9923

手差しトレイに封筒をセットして印刷する
↓↓↓↓↓
https://faq.brother.co.jp/app/answers/detail/a_id/9919

【インクジェット プリンター】手差しトレイに記録紙をセットする方法
↓↓↓↓↓
https://faq.brother.co.jp/app/answers/detail/a_id/10626

https://support.brother.co.jp/j/b/producttop.aspx?c=jp&lang=ja&prod=mfcj997dn
こちらですか。

https://www.brother.co.jp/product/printer/inkjet/mfcj997dn/spec/index.aspx


対応している封筒のサイズは、洋形2号封筒、洋形4号封筒、長形3号封筒、長形4号封筒、COM-10、DL封筒です。坪量80g/m2～95g/m2のものをお使いください。印刷時にパソコンのアプリケーション上で余白の設定が必要なことがあります。印刷する前に、同じ大きさの用紙などを使用して試し印刷を行ってください。また、以下の封筒は故障や紙詰まりの原因となるので使用できません。・窓付き封筒・エンボス加工がされたもの・留め金がついたもの・内側に印刷がほどこされているもの・ふたにのりが付いているもの・二重封筒（ふたの部分が二重になった封筒）・ふたが円弧、または三角のもの


とはなってますね。


【インクジェット/レーザー プリンター】任意で用紙サイズを設定したい（ユーザー定義サイズ）
https://faq.brother.co.jp/app/answers/detail/a_id/13496
ご自身で書かれていますがプリンタドライバ側は上記を参考に設定すれば良いでしょう。

https://support.brother.co.jp/j/b/manualtop.aspx?c=jp&lang=ja&prod=mfcj997dn
マニュアルを見ると確かにプリンタ本体の操作パネルから用紙の種類・サイズの設定をする項目はありますが長形40号はそもそも定形外のサイズで選択肢としては出てこないですね。

多目的トレイにセットして印刷すれば良いかと。

【インクジェット プリンター】封筒のセット方法や印刷設定方法
https://faq.brother.co.jp/app/answers/detail/a_id/9922
パソコン側ではユーザー設定が出来たのならこれで印刷できませんか？