スキャンした画像に酷い色ムラとぼやけ(>_<)

浮いてしまい、被写体がぼやけることがあります。その時は、手で押さえるとかして密着させるとよい。本であるなら、可能性あり。影ができるのは当たり前。コピーでも同じですよ。スキャナーによっては、本や雑誌をスキャンするときは、真ん中の折り目を薄く補正できる機能の付いたものもあります。光が漏れると黒っぽくなってしまいます。もういいちど、取扱説明書を読んでみましょう。

大量にスキャンを行っているのであれば、故障・・もありうるとは思いますが、
一度、電源コンセントを抜いて、挿し直して、リセットしてみてはどうでしょうか？

また、ひたすら本のスキャンを繰り返しているのであれば、
文書とか、カタログとか、白紙とか、ガラス台に密着させることができて、カバーもしっかり閉じることができるような原稿で何度かスキャンテストをしたほうが良いように思います・・
いろいろ原稿を変えても同じとなると、ダメかも・・です。

本の形態のままスキャンしているならば、開いたのどの部分はスキャン面から遠ざかることとなり、暗く、ピントが合わなくなってしまいます。

そのスキャナの採用している方式により程度は違いますが、多かれ少なかれ、その現象は起こってしまいます。

＞スキャナーのCCDとCISの違いは？
＞http://trendy.nikkeibp.co.jp/article/qa/20060125/115144/

本を破壊せずに、そのような影が生じることを避けられる、電子書籍化むけのスキャナも販売されています。

＞本を裁断せずに非破壊でスキャンできるスキャナ「ScanSnap SV600」
＞http://gigazine.net/news/20130628-scansnap-sv600/

スキャン時点では歪んでいますが、紙のゆがみを読み取って、元のページを再現できます。

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そういう話ではなく、スキャナヘッドの動く方向にボケが出るようになってしまった、というならば、故障でしょう。

修理に出すしかないと思いますが…。

原稿台から原稿が浮いて、ガラスにきちんと密着してないと、そういう状態になります。

本を開いて、見開き状態にしてスキャンする場合、どうしても「本の一部が浮く」ので、強く押し付けてスキャンするか、本の背の部分を裁断機で切り落として、ページをバラバラにしてスキャンして下さい。