両面印刷の設定方法と向き合わせについての質問

プリンターの機種名もコンピュータのOS名も記載が無いので、
一般論になりますが、
まずは
・ブラザー製のドライバーを正しく適用していること
→いきなりUSBケーブルを挿すなどすると、OS添付ドライバーが適用され、
最小限の機能しかサポートされないので、本来の性能を発揮できません。
次に
・両面印刷の、「とじしろ」の設定を正しく行うこと。
これが一番大事です。
→とじしろをきちんと設定しないと、ホチキスやクリップで止めることを前提に、適宜ページを回転させて印刷をする機能が最適化されません。
たとえばA4縦置きの原稿を短辺綴じになっていると、上を綴じるので、
めくりあげたときに正対するように印刷されますから、
紙単体で裏返せば、当然、上下逆になります。

自動両面印刷 対応プリンターなら
長辺綴じ、短辺綴じをを変更？
https://support.brother.co.jp/j/b/faqend.aspx?c=jp&lang=ja&prod=dcpj4210n&faqid=faq00012120_012

自動両面印刷 機能の無いプリンターなら
MFC-J820DN / MFC-J820DWNの場合
https://support.brother.co.jp/j/b/faqend.aspx?c=jp&lang=ja&prod=mfcj820dn&faqid=faq00012120_011
使用されてるプリンターで
「両面印刷をするにはどうすればよいですか。」で検索してみますか？
https://support.brother.co.jp/j/b/productsearch.aspx?__CAMCID=GCepbmkAFw-183&__CAMSID=oOFiKhIQFC-27&__CAMVID=FuefIKhiQFC&_c_d=1&_ct=1569118189889&c=jp&content=faq&lang=ja
私は用紙の右下の角にマークを付け印刷し
裏面を印刷する時にどのようにセットすればよいか考えます。

縦長の冊子なら長辺綴じ、横長の冊子なら短辺綴じでいかがでしょうか。
手差し印刷なら、試し刷りで紙の一部に印をつけて印刷方向を知る方法がありますが。

PCのOS、プリンターの機種名を表記しなければ無理　!