一部のFTP接続とVPN接続ができません

基本的には、まず会社の情報システム部に問い合わせてください。

＞ Server response: '425 Security: Bad IP connecting.'

こう出ているのですから、そのFTPサーバはIPアドレスにより接続元制限が設定されていると考えられます。

自社内からの接続、協力会社からの接続はできても、自宅インターネット回線や携帯電話テザリング、公衆Wi-Fi等のインターネットからでは、接続できないというわけです。

＞「L2TP-VPNサーバーが応答しませんでした」

これこそ情報システムに問い合わせるべきで、外部からのVPN接続方法が変わったのかもしれません。
まあ、自宅インターネットの環境により、VPN接続ができないという可能性も有ります。
自宅インターネットの情報もある程度集めて、「なぜVPN接続できないのだろうか」と、自社の情報システムに聞いてみるべきです。

VPN接続できれば、どこにいても社内扱いになりますので、FTP接続も成功するでしょう。

(1)そのMacからインターネットにはアクセスできていますか？
(2)会社でのIPアドレス割当は、固定IPでしたか、DHCPによる割当でしたか？
(3)現在のIPアドレスはグローバルですかプライベートですか？
(4)WRC-1750GST2はルータモードで動いていますか？

自宅のルータの内側にMacがあるなら、FTPのポートとかVPNのポートを開けないと外部とのやり取りはできないと思います。