中クリックの割り当てができません。

＞マウスアシスタントをインストールしていない状態でしたら中クリックは動作しました。
＞しかしマウスアシスタントをインストールすると、中クリックを割り当てることは不可能のようです。
M-DPT1MRXBKは形状が特殊な凝った造りの製品ですので、普通の形状のマウスのように全ての機能割当が出来ないのかも知れませんが、購入直後ということですので、初期不良かどうかの確認も兼ねて、エレコムのカスタマーサポートに問い合わせて症状を伝えてみては如何ですか？
M-DPT1MRXBKの製品固有の問題もあれば、そこで確認出来ると思いますが。。。

M-DPT1MRXBK（トラックボール“DEFT PRO”（人差し指操作タイプ））ですね。
https://www.elecom.co.jp/products/M-DPT1MRXBK.html

「エレコム マウスアシスタント」のヘルプページを参照しましょう。
以下のページで日本語版を開いてください。
https://www.elecom.co.jp/support/manual/peripheral/mouse/assistant/mac/help/

左側の「設定画面の操作」→「ボタン機能割当画面」を選ぶと、、、
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中クリック／オート スクロール(FireFox)：
　中クリック/オートスクロール機能を有効にします。
● Firefoxのみ動作可能です。
● Macintosh標準のマウス(Mighty Mouse)で、ボタンに機能が設定されている場合は、正しく動作しないことがあります。
----------------------
と記載されています。
Firefoxブラウザ以外では使えない機能のようですが。。。