複数のファイルを開いた時に困っていること

> インターネットの閲覧のみにしかPCは使っていませんが、それでも関係するのでしょうか。

ネットの閲覧に使っているブラウザ次第です。
MDI仕様のブラウザであれば、そういう動作を行う設定があるかも知れません。

タブブラウザなんかであれば、×ボタンで全部のタブを閉じますし。

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問題の起きる環境をきちんと補足した方が良いと思います。
・使用しているブラウザは？
・最大化の操作は？
・問題の起きるサイト、起きないサイトの具体例は？
など。


> こうなりだしたのは、つい最近で、それまでは普通にできてました。

手っ取り早い手段ですと「システムの復元」機能でおかしくなる前の日付の設定に戻すとか。

IBM/lenovoのサポートページ - システムの復元の手順
http://www-06.ibm.com/jp/domino04/pc/support/beginner.nsf/btechinfo/SYB0-021CB40

> 容量不足なんでしょうか。
> それともマウスの故障でしょうか。

どちらも問題なくて、アプリケーションの関連付けの問題と考えられます。

Windowsのアプリケーションが文書を開く際には、SDI、MDIという２種類の方式があります。

SDIは、メモ帳やペイントに代表されるもので、
・1つのアプリケーションが1つのファイルのみ開く。
・アプリにファイルをドラッグ＆ドロップすると、以前のファイルは閉じる。

MDIはWordなどに代表されるもので、
・1つのアプリケーションが複数のファイルを開く。
・アプリにファイルをドラッグ＆ドロップすると、以前のファイルは閉じずに、新しいウィンドウを表示。

です。

大昔のWindows3.1の時代には、親のアプリケーションのウィンドウ中に子の文書のウィンドウが表示されるので見分けが簡単だったんですが、さすがに不便との事で、最近は曖昧な動作をするアプリが多くなりました。

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> 今見ているファイル画面が必要なくなり、開いているもう一つのファイル画面にする為、右上の×をクリックすると、なぜだか開いていたもう一つのファイルも消えてしまうんです。

ファイルを開くときに、
・既に開いているWordでもう一つ文書を開く。
・新たにメモ帳を起動して新規に文書を開く。
の動作の関連付けの問題だと思います。

MDIの場合で、右上の×が「Wordを終了しろ」という操作に相当しますから、開いていた他のファイルも閉じます。
WordやExcelなら、ウィンドウの内側にもう一組×ボタンがあるのでそちらをクリックか、[ファイル]-[閉じる]の操作を行って下さい。

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> どうすれば元の状態に戻りますでしょうか？

対象のアプリケーションごとに設定が異なるので、何とも回答できません。
おおむね関連付けの設定で、Wordなら関連付けのDDEの設定とか？