バックアップの意味と効果的な方法とは？

なにか根本的な勘違いがあるような気がします。

まずは、windows7におけるバックアップについて確認してみてください。

http://support.microsoft.com/kb/2666277/ja

また、単純にバックアップといっても、windpws7についている、バックアップ機能、以外にも方法があるのですが、質問者さんは、それをいっているのではないと思いますので。

質問にあった、インターネットエクスプローラの、お気に入りだけの、問題ならば、単純に、初期化（購入時の状態に戻す）前に、お気に入りのフォルダーをドラッグドロップで、外部にコピーしておいて、
それを初期化した後に、コピーしてもどすだけでも、可能です。

　確かにバックアップを取る意味が無いものもあります。

　ＩＥの設定情報や記録情報は基本的にバックアップしません。理由は意味が無いからです。パソコンを買い換えた時に、旧パソコンでＩＥの設定を表示して、それを見ながら検索で調べて一つずつ新パソコンのＩＥに入力しています。

　パソコンを２台以上持っていれば、一度に全てのパソコンがシステムダウンしませんから、２台とも消えた事はありません。

　バックアップデータも２台のパソコンに同じデータを保管して置けば、同時に２台とも消える事は、まず、ありません。外付けＨＤＤよりも安全かもしれませんね。

　もっとも、新旧で性能差が大きく、ＨＤＤ容量が１桁違うので、同じ情報を共通して持つのは無理な場合もありますので、バックアップが必要になります。

　バックアップと言っても、週に１回か、月に１回ぐらい、ＨＤＤの重要データをまとめて保存して置けば良いだけです。頻繁に更新する情報は毎回バックアップしなければなりませんが、一般には大量にデータをパソコンに入れた時だけバックアップしています。

　必ずバックアップしなければならないのではなくて、重要度に応じてバックアップの頻度を選べば良いでしょう。バックアップの重要度に等級を設けて置けば良いと思います。

１．重要データ

　毎回、必ずバックアップしなければならない重要なデータで、自作のソフト、写真画像、動画など。

２．通常データ

　毎週か、毎月１回、バックアップすれば良いもので、消失しても、インターネットからダウンロード出来る種類のもの。フリーソフト、YouTube動画など。

　重要データは２つ以上、同じバックアップを作って置いた方が良いですが、通常データは大量ですし、ダウンロードすれば良いので、１つだけで十分です。

　情報の重要さに応じて、バックアップのレベルを考えれば良いでしょう。

＞「お気に入り」をバックアップしたとしても、購入当時状態のPCのお気に入りに、バックアップを取ったお気に入り情報を一瞬でコピーするのは不可能ですよね？

いいえ。お気に入りは、C:\Users\ユーザー名\Favorites(☆）フォルダにショートカットとして保存されていますから、このフォルダをバックアップしたらよいです。
(重要なデータのバックアップ)
http://support.lenovo.com/ja_JP/detail.page?LegacyDocID=13068200751022

また、IEが起動できるのでしたら、htmlファイルにエクスポートしておいたら、インポートで復元できますので、ダブルでバックアップしておいたらよいです。
（Internet Explorer 8/9/10 ： 「お気に入り」のバックアップと復元方法 )
http://faq.epsondirect.co.jp/faq/edc/app/servlet/relatedqa?QID=029456